33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1708 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  711    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  43.54 
 
 
478 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  41.98 
 
 
383 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  38.67 
 
 
425 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  39.44 
 
 
419 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  31.49 
 
 
416 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  35.97 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  33.76 
 
 
421 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  33.76 
 
 
420 aa  93.2  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  34.81 
 
 
426 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  33.97 
 
 
430 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  30.6 
 
 
440 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  32.34 
 
 
421 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  32.34 
 
 
421 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  31.07 
 
 
438 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  25.5 
 
 
363 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  31.07 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  34.39 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  33.12 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  32.93 
 
 
420 aa  86.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  30.13 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  29.45 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  31.85 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1647  hypothetical protein  30.86 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0538645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  31.16 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3435  hypothetical protein  26.26 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000106103  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.45 
 
 
530 aa  53.1  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3517  hypothetical protein  21.43 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000550891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3799  hypothetical protein  21.43 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000157836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3440  hypothetical protein  21.43 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000469618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>