30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1009 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  870    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  85.58 
 
 
430 aa  764    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  76.29 
 
 
438 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  77.23 
 
 
438 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  73.71 
 
 
430 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  66.18 
 
 
420 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  65.23 
 
 
421 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  64.75 
 
 
421 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  64.75 
 
 
421 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  65.46 
 
 
426 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  66.36 
 
 
419 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  63.2 
 
 
420 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  63.29 
 
 
420 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  63.07 
 
 
421 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  62.98 
 
 
440 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  61.43 
 
 
425 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  67.72 
 
 
383 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  47.12 
 
 
424 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  43.53 
 
 
418 aa  356  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  39.58 
 
 
414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  42.31 
 
 
416 aa  346  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  42.41 
 
 
411 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  43.14 
 
 
407 aa  317  2e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  37.57 
 
 
478 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  31.95 
 
 
348 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  31.33 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  26.75 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0669  hypothetical protein  28.81 
 
 
242 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  23.19 
 
 
243 aa  50.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  20.81 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>