69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6703 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6703  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  100 
 
 
236 aa  490  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.183596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3016  chromosome partitioning ATPase  26.19 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1486  conjugative transposon protein TraA  26.42 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.450088 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.71 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  27.65 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.29 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  33.52 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  29.72 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  46.67 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.99 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  28.79 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.15 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.09 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  27.92 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  54.76 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  26.5 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.17 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.35 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03571  putative septum site-determining protein MinD  51.22 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.377857  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6913  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  24.32 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0052  hypothetical protein  40.38 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00581  chromosome partitioning ATPase protein  40.38 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00591  chromosome partitioning ATPase protein  40.38 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.19 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00611  chromosome partitioning ATPase protein  40.38 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.32 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  52.5 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.33 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.5 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.24 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  27.56 
 
 
383 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  52.5 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  28.67 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  50 
 
 
279 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  23.68 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  53.49 
 
 
212 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.85 
 
 
212 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
262 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  24.53 
 
 
284 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>