32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6701 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 440 aa  901    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3761  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.2 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4196  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.24 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3563  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.05 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4380  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.92 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.31 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.92 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.46 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.74 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  29.7 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.17 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.01 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.26 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.71 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.43 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.55 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  27.97 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.33 
 
 		 807 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.87 
 
 		 804 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.98 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  31.75 
 
 		 873 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  26.71 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.77 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.77 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  26.14 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  25.64 
 
 		 746 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  25 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.99 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  26.53 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.87 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0321  hypothetical protein  26.53 
 
 		 510 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>