79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2508 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2508  competence protein F  100 
 
 		 261 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.7 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.43 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  38.29 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  35.84 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  35.78 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  35.06 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  35.06 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.8 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  35.56 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.95 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.4 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  38.74 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  33.2 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  34.6 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  36.24 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  25.98 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  40.44 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.72 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.51 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.74 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.6 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.01 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  33.52 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  29.9 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  33.04 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  34.26 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.95 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  23.76 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  25.1 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  29.12 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  22.58 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.83 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.26 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  22.75 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  22.75 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  22.87 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  29.07 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  29.22 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  40.98 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.5 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  58.82 
 
 		 189 aa  42.7  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  57.78 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  58.82 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  26.72 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  39.09 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  32.47 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  26.72 
 
 		 237 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  42  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  29.27 
 
 		 286 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>