More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0358 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  55.45 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  55.5 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  52.36 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  54.79 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  56.29 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  53.61 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  47.94 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  49.07 
 
 		 190 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  50.28 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  54.97 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  50 
 
 		 192 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  47.98 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  47.4 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  51.59 
 
 		 180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  48.78 
 
 		 162 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  53.02 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  49.07 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.53 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  49.7 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  46.24 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.5 
 
 		 181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  51.95 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  45.88 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  41.08 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  49.69 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  49.39 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  40.7 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  47.8 
 
 		 167 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  49.07 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  49.38 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  43.71 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.98 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  45.1 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  43.37 
 
 		 168 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  47.77 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  43.23 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  42.17 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  41.57 
 
 		 168 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.48 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  42.17 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.04 
 
 		 185 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  44.3 
 
 		 182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.14 
 
 		 170 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.14 
 
 		 170 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  43.95 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  31.5 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  31.82 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  42.17 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  44.77 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.21 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.61 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  40 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  39.75 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  44.3 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  39.55 
 
 		 169 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  43.31 
 
 		 188 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.64 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  40.49 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.02 
 
 		 167 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.7 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.63 
 
 		 167 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.77 
 
 		 168 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  41.4 
 
 		 169 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  38.69 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  39.77 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  48.67 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  42.59 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.75 
 
 		 181 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  32.37 
 
 		 169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  45.62 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  42.07 
 
 		 164 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  45.62 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  45.62 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  44.1 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  40.61 
 
 		 169 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  39.29 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  39.29 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  45.96 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40.56 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  40.12 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>