106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3698 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  81.29 
 
 		 450 aa  747    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  922    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  37.83 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  38.01 
 
 		 658 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  40.24 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.5 
 
 		 254 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  38.36 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  26.99 
 
 		 660 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  31.18 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  31.52 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  41.18 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  31.48 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  25.98 
 
 		 313 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.17 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  30 
 
 		 1421 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  40.28 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  36.09 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  31.25 
 
 		 206 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  31.87 
 
 		 836 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  31.32 
 
 		 836 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  34.13 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  30.68 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  29.23 
 
 		 597 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  34.38 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  30.95 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  44.74 
 
 		 995 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  30.07 
 
 		 552 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  31.96 
 
 		 195 aa  50.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  32.26 
 
 		 188 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  34.12 
 
 		 206 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.04 
 
 		 1635 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  36.26 
 
 		 185 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  31.96 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  39.56 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  31.54 
 
 		 1412 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.96 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  29.21 
 
 		 1414 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 1516 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 233 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.71 
 
 		 275 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 260 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  26.05 
 
 		 157 aa  47.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  36.21 
 
 		 247 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 1674 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  36.84 
 
 		 210 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  30.36 
 
 		 230 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 275 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  30.72 
 
 		 2570 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  28.24 
 
 		 197 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  32.39 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  28.15 
 
 		 623 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  33.65 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  29.13 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.01 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  31.29 
 
 		 1575 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  34.94 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 		 554 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  33.63 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.69 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  24.88 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.33 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1892  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.56 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 237 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  31.51 
 
 		 629 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4029  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.14 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  27.82 
 
 		 199 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  31.87 
 
 		 199 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  31.97 
 
 		 201 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  32.41 
 
 		 646 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  30 
 
 		 229 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  29.32 
 
 		 515 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  40.62 
 
 		 206 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 274 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  40.7 
 
 		 245 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  29.41 
 
 		 206 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  27.44 
 
 		 1117 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  30.59 
 
 		 206 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  31.1 
 
 		 1700 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  27.87 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 1697 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  40.38 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  30.34 
 
 		 208 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 300 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1118 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 300 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>