261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4098 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  100 
 
 
230 aa  476  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  92.64 
 
 
231 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  90.48 
 
 
231 aa  430  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  84.16 
 
 
222 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  80 
 
 
229 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  79.72 
 
 
222 aa  362  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  75.45 
 
 
220 aa  348  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  65.2 
 
 
221 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  64.56 
 
 
215 aa  276  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  62.21 
 
 
217 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  64.71 
 
 
220 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  61.69 
 
 
229 aa  274  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  61.69 
 
 
229 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  61.69 
 
 
229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  60.89 
 
 
242 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  62.94 
 
 
214 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  57.21 
 
 
211 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  57.07 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  51.24 
 
 
217 aa  201  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  49.51 
 
 
222 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  49.75 
 
 
201 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  52.04 
 
 
195 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  46.34 
 
 
210 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  44.44 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  47.45 
 
 
195 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  40.7 
 
 
198 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  41.5 
 
 
211 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  45.83 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  41.62 
 
 
199 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  38.5 
 
 
196 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  39.8 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  39.8 
 
 
206 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  42.49 
 
 
201 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  42.49 
 
 
201 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  39.39 
 
 
206 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  39.8 
 
 
206 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  44.19 
 
 
206 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  40.39 
 
 
203 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  38.38 
 
 
209 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  39.8 
 
 
206 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  39.5 
 
 
210 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  38.78 
 
 
206 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  38.61 
 
 
212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  38.27 
 
 
206 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  39.29 
 
 
206 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  42.59 
 
 
206 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  39.29 
 
 
206 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  37.37 
 
 
200 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  40.12 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  40.74 
 
 
205 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  41.21 
 
 
200 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  38.58 
 
 
203 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  39.58 
 
 
229 aa  148  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  43.1 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  44.2 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  36 
 
 
205 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  44.2 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  44.2 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  44.2 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  44.2 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  44.2 
 
 
202 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  41.76 
 
 
196 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  41.76 
 
 
203 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  39.3 
 
 
211 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  40.64 
 
 
215 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  39.3 
 
 
211 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  39.22 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  36.36 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  42.54 
 
 
202 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  39.66 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  38.92 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  35.35 
 
 
197 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  38.32 
 
 
202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  39.59 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  39.57 
 
 
194 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  39.23 
 
 
202 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  41.62 
 
 
194 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  36.98 
 
 
195 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  39.01 
 
 
202 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  37.37 
 
 
194 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  38.5 
 
 
194 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  38.67 
 
 
202 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  38.5 
 
 
194 aa  121  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  40.96 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  41.14 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  40.3 
 
 
194 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  33.13 
 
 
201 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
1287 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  26.59 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.82 
 
 
297 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  32.43 
 
 
1085 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  31.82 
 
 
488 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
1314 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>