More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2761 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 544 aa  1098    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  64.98 
 
 		 544 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  49.14 
 
 		 524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  49.23 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  45.37 
 
 		 558 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  47.22 
 
 		 528 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  49.32 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.17 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  45.86 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.14 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  46.55 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  47.75 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  44.63 
 
 		 542 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.56 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  42.4 
 
 		 531 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.7 
 
 		 529 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  41.43 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  38.91 
 
 		 529 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  38.98 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 		 529 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  39.81 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  41.11 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  40.43 
 
 		 515 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  42 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.64 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  41.12 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  41.67 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  41.92 
 
 		 534 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  39.8 
 
 		 536 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 516 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.08 
 
 		 531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  40.88 
 
 		 533 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  37.17 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 528 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  39.37 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  36.22 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  36.59 
 
 		 538 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 538 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 539 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  35.27 
 
 		 538 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 538 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 530 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 535 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  35.99 
 
 		 533 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 532 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 		 531 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  35.91 
 
 		 546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.34 
 
 		 538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  48.64 
 
 		 259 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 		 533 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 540 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  32.16 
 
 		 540 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 539 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 551 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 559 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 		 519 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.54 
 
 		 508 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  30.04 
 
 		 541 aa  207  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.71 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.51 
 
 		 511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 		 576 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 526 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  35.79 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 		 531 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 494 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.79 
 
 		 505 aa  193  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 532 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 529 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.84 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 		 508 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 527 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.6 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.47 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.47 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>