More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0415 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  44.33 
 
 
307 aa  250  2e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  42.95 
 
 
308 aa  249  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.42 
 
 
368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.62 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2767  RluA family pseudouridine synthase  38.76 
 
 
330 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.901259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2102  pseudouridine synthase, RluD  38.16 
 
 
405 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2837  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.81 
 
 
436 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0449259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0624  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.15 
 
 
354 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  33.55 
 
 
325 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2505  RluA family pseudouridine synthase  36.78 
 
 
346 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.93 
 
 
318 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.948591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.93 
 
 
326 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0315  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.37 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.458148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.98 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  35.05 
 
 
330 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  35.62 
 
 
326 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0391  RluA family pseudouridine synthase  35.67 
 
 
346 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  34.27 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  35.69 
 
 
329 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.73 
 
 
348 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  33.85 
 
 
330 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0164  RluA family pseudouridine synthase  35.05 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1648  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.63 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1312  RluA family pseudouridine synthase  33.23 
 
 
350 aa  188  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  33.12 
 
 
457 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  32.29 
 
 
469 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.23 
 
 
458 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0790  RluA family pseudouridine synthase  32.93 
 
 
348 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.143813  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  32.81 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2261  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.96 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.65 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.397176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1394  pseudouridine synthase, RluD  33.23 
 
 
412 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.377241  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0556  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.85 
 
 
305 aa  181  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  32.8 
 
 
446 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0090  pseudouridine synthase, RluA family  33.43 
 
 
349 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.768556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  31.96 
 
 
501 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1575  pseudouridine synthase, RluD  32.3 
 
 
411 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4767  RluA family pseudouridine synthase  29.18 
 
 
364 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305838  hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  30.94 
 
 
468 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  31.25 
 
 
468 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  31.15 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3624  pseudouridine synthase, RluA family  30.97 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3129  pseudouridine synthase RluD  31.21 
 
 
444 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411663  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2335  pseudouridine synthase RluD  30.57 
 
 
453 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.134936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.25 
 
 
328 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22770  pseudouridine synthase, RluA family  32.45 
 
 
318 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.77 
 
 
316 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  32.97 
 
 
278 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  30.67 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1517  RluA family pseudouridine synthase  29.01 
 
 
333 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000147946  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2242  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  32.51 
 
 
315 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5337  pseudouridine synthase  36.24 
 
 
224 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.588803  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.49 
 
 
321 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27015  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1482  RluA family pseudouridine synthase  29.01 
 
 
333 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286389  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3840  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.33 
 
 
318 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3808  RluA family pseudouridine synthase  28.33 
 
 
333 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0127606  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.59 
 
 
332 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.42 
 
 
314 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2214  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  32.16 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.27 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0336491  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2510  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.61 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.22 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1639  pseudouridine synthase, RluD  28.33 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.289887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1580  pseudouridine synthase, RluA family  30.49 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000241554  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  31 
 
 
326 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2815  23S rRNA pseudouridylate synthase C  28.71 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000464709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1616  pseudouridine synthase, RluA family  29.93 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  41.86 
 
 
226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.93 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1883  pseudouridine synthase  37.56 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135329  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.25 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050794  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2001  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.81 
 
 
319 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000244921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  34.42 
 
 
306 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1570  23S rRNA pseudouridylate synthase C  31.25 
 
 
320 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000517495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  31.08 
 
 
313 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  33.12 
 
 
313 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  30.41 
 
 
339 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.06 
 
 
329 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.06 
 
 
329 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.06 
 
 
329 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01082  23S rRNA pseudouridylate synthase  29.49 
 
 
319 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000778536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2561  pseudouridine synthase, RluA family  29.49 
 
 
319 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000499668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.7217399999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01090  hypothetical protein  29.49 
 
 
319 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000557514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2515  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000444551  hitchhiker  0.0000916413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1751  RluA family pseudouridine synthase  29.26 
 
 
329 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000123206  normal  0.30128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1875  RluA family pseudouridine synthase  28.23 
 
 
317 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.763374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1299  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.547954  hitchhiker  0.000000178257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1284  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0174547  hitchhiker  0.00000000220374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2041  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  hitchhiker  0.000351853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1255  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242253  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2185  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012302  hitchhiker  0.000000000136846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4412  pseudouridine synthase  35.29 
 
 
228 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1464  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.49 
 
 
319 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000220754  hitchhiker  0.00000000172116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1757  pseudouridine synthase, RluA family  32.37 
 
 
346 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0151064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.43 
 
 
327 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1574  RluA family pseudouridine synthase  28.62 
 
 
330 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00553384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1899  23S rRNA pseudouridylate synthase C  29.45 
 
 
320 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000584108  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>