230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4677 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  63.24 
 
 		 252 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  48.41 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  39.2 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  35.92 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  38.37 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  36.73 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  38.08 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  38.33 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  40.43 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  36.33 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  38.49 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  37.13 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  37.87 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  37.25 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  34 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  34.73 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  34.51 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  34.21 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  32.61 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  31.67 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  30.3 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  29.07 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  29.74 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  29.44 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  28.12 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  32.11 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  28.89 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  30.34 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  30.34 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  27.71 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  27.07 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  31.6 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  30.84 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  29.9 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.43 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  25 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  28.86 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  30.17 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  29.35 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  27.14 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  25.87 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  30.77 
 
 		 410 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  21.63 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  26.37 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  24.76 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.1 
 
 		 378 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  26.37 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  25.87 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  25.87 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.87 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  25.87 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  25.87 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  26.73 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  25.87 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.05 
 
 		 610 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  26.37 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  26.73 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.07 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  25.87 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  30.48 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  26.84 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  22.04 
 
 		 610 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  26.24 
 
 		 385 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  31.53 
 
 		 453 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  31.53 
 
 		 453 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  31.53 
 
 		 450 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  31.53 
 
 		 501 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0797  citrate lyase, subunit 2  22.36 
 
 		 610 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  23 
 
 		 372 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  31.53 
 
 		 450 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.7 
 
 		 367 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.7 
 
 		 367 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  30.88 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.48 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  29.81 
 
 		 410 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6135  citrate synthase-like protein  29.33 
 
 		 416 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822109  normal  0.0240059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.29 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.63 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3155  citrate synthase-related protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2891  citrate synthase-related protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0704  hypothetical protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0982036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.15 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  25.24 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  25.13 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  25.13 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0125  citrate synthase-related protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1463  citrate synthase-related protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0520  citrate synthase-related protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0538  citrate synthase-related protein  31.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0221269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  27.23 
 
 		 398 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  25.25 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  25.74 
 
 		 387 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  27.65 
 
 		 385 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  22.55 
 
 		 377 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  23.04 
 
 		 374 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  28.22 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  22.22 
 
 		 610 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.57 
 
 		 374 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  29.08 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>