More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1767 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  83.17 
 
 
328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  80.79 
 
 
323 aa  500  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  80.79 
 
 
323 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  77.03 
 
 
312 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  72.64 
 
 
325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  71.52 
 
 
323 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  69.49 
 
 
320 aa  434  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  50.16 
 
 
335 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  51.15 
 
 
331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.36 
 
 
336 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.86 
 
 
333 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.07 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.36 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.07 
 
 
345 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  47.35 
 
 
322 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  47.3 
 
 
309 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.76 
 
 
339 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.74 
 
 
360 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.51 
 
 
327 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.41 
 
 
322 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  45.7 
 
 
331 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.33 
 
 
323 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.52 
 
 
325 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.97 
 
 
349 aa  254  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.18 
 
 
314 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.19 
 
 
339 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.53 
 
 
330 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.53 
 
 
330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.52 
 
 
328 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.86 
 
 
330 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.86 
 
 
330 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.11 
 
 
344 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.85 
 
 
330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.19 
 
 
331 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.51 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.53 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.03 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.51 
 
 
328 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.52 
 
 
328 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.53 
 
 
328 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.28 
 
 
326 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.53 
 
 
355 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.2 
 
 
328 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.53 
 
 
353 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 
328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.47 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.52 
 
 
334 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.72 
 
 
328 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.87 
 
 
325 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.81 
 
 
323 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.62 
 
 
334 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.19 
 
 
356 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  43.97 
 
 
331 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.28 
 
 
358 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  40.86 
 
 
330 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  234  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.06 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.2 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.2 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  43.38 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.76 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.76 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.81 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.86 
 
 
335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  40.86 
 
 
334 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  43.88 
 
 
330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.2 
 
 
328 aa  231  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.19 
 
 
338 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.52 
 
 
335 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.2 
 
 
322 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.81 
 
 
328 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.85 
 
 
331 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  46.03 
 
 
386 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  41.45 
 
 
332 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 
335 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  43.33 
 
 
321 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.83 
 
 
337 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.32 
 
 
324 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.2 
 
 
320 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  42.86 
 
 
330 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40.85 
 
 
339 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 
339 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.53 
 
 
335 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.2 
 
 
324 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  45.85 
 
 
318 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.2 
 
 
304 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  42.33 
 
 
316 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  46.36 
 
 
327 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  41.53 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  42 
 
 
316 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 
331 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.39 
 
 
325 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  42.76 
 
 
336 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.85 
 
 
333 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  41.53 
 
 
327 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.59 
 
 
327 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  43.05 
 
 
330 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>