More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0519 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  99.32 
 
 
309 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  69.25 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1268  hypothetical protein  52.22 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  47.8 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  48.31 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  48.01 
 
 
323 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  46.46 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  47.99 
 
 
323 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  47.35 
 
 
304 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  47.99 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  46.05 
 
 
335 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  46.62 
 
 
312 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  46.05 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.77 
 
 
336 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.52 
 
 
345 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.52 
 
 
345 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.89 
 
 
360 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.48 
 
 
333 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.88 
 
 
339 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.46 
 
 
344 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.66 
 
 
333 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.61 
 
 
349 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.67 
 
 
339 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.67 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.67 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.24 
 
 
326 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.46 
 
 
333 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 
328 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.87 
 
 
324 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.84 
 
 
321 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.84 
 
 
321 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.79 
 
 
327 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.76 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.89 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.62 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  42.62 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.93 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.31 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.67 
 
 
327 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38 
 
 
336 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.26 
 
 
327 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.53 
 
 
328 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.59 
 
 
328 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.48 
 
 
325 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.46 
 
 
335 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.04 
 
 
334 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.6 
 
 
335 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.08 
 
 
331 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.79 
 
 
324 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  36.11 
 
 
321 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.21 
 
 
326 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
334 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.02 
 
 
333 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.21 
 
 
337 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.39 
 
 
330 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  39.42 
 
 
325 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.51 
 
 
330 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  38.29 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.46 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  34.64 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  38.46 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.33 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.92 
 
 
331 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.36 
 
 
343 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.47 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  39.74 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.26 
 
 
322 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  39.2 
 
 
322 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  36.17 
 
 
327 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  38.68 
 
 
337 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.27 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.04 
 
 
325 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.68 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.69 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.6 
 
 
328 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  37.15 
 
 
327 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  39.62 
 
 
331 aa  196  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  33.54 
 
 
356 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.88 
 
 
332 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  39.25 
 
 
335 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  35.11 
 
 
329 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  36.62 
 
 
322 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.57 
 
 
327 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  33.23 
 
 
359 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.27 
 
 
332 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  37.46 
 
 
322 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.74 
 
 
322 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.15 
 
 
332 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  37.25 
 
 
339 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  39.04 
 
 
322 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 
326 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  39.74 
 
 
321 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>