More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0535 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  99.32 
 
 
322 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  69.93 
 
 
331 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1268  hypothetical protein  51.88 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  48.15 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  47.46 
 
 
320 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  47.47 
 
 
323 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  45.87 
 
 
335 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  47.8 
 
 
328 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  47.64 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  47.64 
 
 
323 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  46.13 
 
 
312 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  47.3 
 
 
304 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.87 
 
 
331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46 
 
 
336 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.37 
 
 
345 aa  251  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.37 
 
 
345 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.37 
 
 
360 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.72 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.33 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.74 
 
 
344 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.79 
 
 
333 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.14 
 
 
349 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 
330 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.13 
 
 
339 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.69 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.04 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.36 
 
 
328 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.14 
 
 
328 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.36 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.21 
 
 
333 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.36 
 
 
330 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.12 
 
 
327 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.13 
 
 
327 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.46 
 
 
336 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.03 
 
 
327 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.13 
 
 
328 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 
328 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 
328 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.33 
 
 
324 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.91 
 
 
335 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.33 
 
 
326 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.7 
 
 
334 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.8 
 
 
334 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.45 
 
 
325 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  39.2 
 
 
321 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  39.2 
 
 
321 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  38.59 
 
 
334 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.12 
 
 
330 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  40.27 
 
 
325 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.33 
 
 
334 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37 
 
 
337 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 
326 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.8 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.13 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  37.12 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.13 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.8 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.79 
 
 
330 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 
328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 
331 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  40.46 
 
 
328 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  38.13 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.58 
 
 
331 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  34.75 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  38.59 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  39.6 
 
 
322 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  39.87 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.33 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  38.91 
 
 
322 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.46 
 
 
343 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.49 
 
 
325 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.12 
 
 
334 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.04 
 
 
322 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.67 
 
 
328 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.46 
 
 
336 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  39.6 
 
 
321 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.2 
 
 
339 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  38.33 
 
 
337 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  38.91 
 
 
322 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  38.87 
 
 
321 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 
346 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  38.72 
 
 
331 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  33.99 
 
 
359 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.46 
 
 
331 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  38.7 
 
 
335 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.78 
 
 
329 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  38.46 
 
 
328 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.33 
 
 
332 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.46 
 
 
323 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  37.33 
 
 
339 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  34.56 
 
 
322 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.23 
 
 
327 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  38.38 
 
 
318 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  36.67 
 
 
347 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  36.33 
 
 
327 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>