More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1596 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  36.82 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  32.91 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  31.74 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  32.05 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  29.66 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  28.86 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.77 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  35.53 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  26.84 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  30.06 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.82 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.95 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  27.95 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.25 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.37 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  28.08 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  27.43 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  25.32 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.1 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  28.23 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.32 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  24.86 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  27.43 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  24.86 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  29.75 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  28.86 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.87 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  28.45 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3242  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  24.89 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  28.05 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  24.89 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  26.92 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  23.76 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  26.11 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  25.63 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  27.52 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  25.63 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>