232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0513 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  77.26 
 
 
284 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  62.72 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  58.18 
 
 
281 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  54.98 
 
 
278 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  55.72 
 
 
278 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  53.43 
 
 
285 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  50.53 
 
 
289 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  51.89 
 
 
277 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  52.96 
 
 
285 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  53.33 
 
 
285 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  50.59 
 
 
285 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  51.55 
 
 
277 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  49.06 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  53.03 
 
 
276 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  46.44 
 
 
275 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  44.91 
 
 
279 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  43.89 
 
 
281 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  45 
 
 
264 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  40.86 
 
 
270 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  44.76 
 
 
266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  44.58 
 
 
264 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  27.43 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.22 
 
 
289 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  30.26 
 
 
273 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  27.34 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  31.14 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  29.93 
 
 
272 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  25.75 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.76 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  28.91 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  25.7 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  30.94 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  29.56 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.05 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  28.62 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  29.57 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.73 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  24.81 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  29.01 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  30.57 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  28.01 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  28.77 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  25.09 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  27.57 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  26.02 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  24.16 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.2 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  25.34 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.07 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  24.82 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.84 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  26.16 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  26.58 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  26.32 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  25.61 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  26.32 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  26.32 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  25.8 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  26.22 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  26.06 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  27.54 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  25.35 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  26.1 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  26.28 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  25.68 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  24.66 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  25.91 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  21.77 
 
 
449 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  23.57 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  26.16 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  24.91 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  27.34 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  26 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  26.55 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  26.33 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  23.81 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  25.68 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  26.33 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  23.67 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  27.15 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  26.92 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  25.42 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  26.1 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  24.75 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  25.44 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  22.61 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  26.28 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  25.61 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  24.81 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  24.28 
 
 
453 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.76 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  27.87 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  23.66 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  28.39 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  26.78 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  26.17 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>