145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6262 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  69.61 
 
 		 304 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  50.52 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  50.7 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  50.9 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  51.07 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  51.07 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  50.71 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  48.24 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  48.42 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  50 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  50.57 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  47.04 
 
 		 321 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  47.33 
 
 		 315 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  48.96 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  46.18 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  45.93 
 
 		 274 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  44.91 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  45.11 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  45.11 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  44.74 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  46.18 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  39.77 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  42.91 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  39.39 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  43.56 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  40.53 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  38.46 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.82 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.94 
 
 		 289 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.94 
 
 		 275 aa  185  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.59 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  38.6 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  40.56 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.31 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.83 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  49.46 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  49.46 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  39.01 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  35.9 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  40.22 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 304 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.49 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  38.55 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  36.82 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.99 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.19 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  38.41 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  35.46 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  35.29 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  34.6 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  34.31 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  37.8 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  35.04 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.91 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  33.81 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  39.56 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.1 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.9 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  34.06 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  36.92 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  36.67 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  38.08 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  35.56 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  32.09 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  33.45 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  34.78 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.84 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  31.82 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.84 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.84 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.84 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.84 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.84 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.84 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  31.72 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  31.34 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 281 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>