More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5225 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  100 
 
 		 427 aa  857    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  86.54 
 
 		 416 aa  737    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  65.69 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  61.96 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  60.61 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  61.85 
 
 		 436 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  56.24 
 
 		 424 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  58.65 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  63.15 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  63.42 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  62.91 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  52.61 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  57.58 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  54.61 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  52.24 
 
 		 447 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  52.84 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  52.84 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  52.94 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  55.21 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  51.77 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  54.25 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  54.31 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  50.23 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  48.96 
 
 		 1018 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  48.57 
 
 		 1049 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  48 
 
 		 1023 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  47.76 
 
 		 1016 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  51.45 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  45.73 
 
 		 1015 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  45.5 
 
 		 1015 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  45.97 
 
 		 1015 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  48.56 
 
 		 978 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  46.19 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  41.9 
 
 		 981 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  41.43 
 
 		 981 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  41.43 
 
 		 981 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  43.65 
 
 		 994 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  39.3 
 
 		 977 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  39.91 
 
 		 975 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  38.35 
 
 		 976 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  37.97 
 
 		 966 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  38.12 
 
 		 910 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  37.79 
 
 		 970 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  38.82 
 
 		 973 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  40.47 
 
 		 973 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  41.36 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  37.65 
 
 		 976 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  36.92 
 
 		 970 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  38.48 
 
 		 1003 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  39.29 
 
 		 967 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  37.41 
 
 		 970 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  37.09 
 
 		 974 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.49 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  35.89 
 
 		 431 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  35.81 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  36.71 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  35.45 
 
 		 457 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  37.5 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.85 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  36.78 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  36.78 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  36.3 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  36.06 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  36.06 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  34.32 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 433 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  33.96 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  33.64 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.17 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  35.49 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  31.06 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  34.27 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  34.99 
 
 		 451 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  35.75 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 454 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  31.85 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.43 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  35.9 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  33.03 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  33.41 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  31.28 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4493  aminotransferase class-III  36.06 
 
 		 436 aa  186  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  31.28 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  31.28 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  31.28 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  31.28 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  31.29 
 
 		 395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  31.28 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  35.01 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.44 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>