More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1102 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  100 
 
 		 318 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  77.39 
 
 		 316 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  77 
 
 		 315 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  77.07 
 
 		 316 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1779  transaldolase B  75.39 
 
 		 316 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  75 
 
 		 317 aa  484  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  76.04 
 
 		 315 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  74.44 
 
 		 315 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0654  transaldolase B  77.32 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.0202899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  75.72 
 
 		 315 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  68.69 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  65.51 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4350  transaldolase B  65.81 
 
 		 320 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  67.52 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  65.81 
 
 		 319 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3318  transaldolase B  67.1 
 
 		 317 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0830908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  64.65 
 
 		 319 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  64.01 
 
 		 319 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  64.31 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0296  transaldolase B  64.95 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0852  transaldolase B  64.95 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1940  transaldolase B  64.95 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  64.24 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1174  transaldolase B  65.27 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1326  transaldolase B  65.27 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2358  transaldolase B  65.48 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0962  transaldolase B  66.13 
 
 		 317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1013  transaldolase B  64.95 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.930396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1166  transaldolase B  65.27 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1723  transaldolase B  65.81 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2335  transaldolase B  65.81 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0942  transaldolase B  64.95 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0291755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5677  transaldolase B  65.48 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2254  transaldolase B  64.19 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2374  transaldolase B  64.19 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1265  transaldolase B  59.49 
 
 		 339 aa  362  6e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.785654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0685  transaldolase B  58.6 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.947987  normal  0.786497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  58.73 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  60.26 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  58.33 
 
 		 323 aa  348  6e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  58.75 
 
 		 319 aa  346  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  56.92 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  57.05 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  59.22 
 
 		 307 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  55.49 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74289  transaldolase  59.12 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.318947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  57.96 
 
 		 308 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  56.88 
 
 		 316 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  58.01 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  55.8 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  57.32 
 
 		 308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  58.33 
 
 		 309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  57.64 
 
 		 308 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  55.35 
 
 		 318 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  56.65 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  55.03 
 
 		 318 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  55.03 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  56.74 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  55.03 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  56.21 
 
 		 317 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  53.92 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  56.21 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  55 
 
 		 316 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  56.21 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  58.92 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  56.43 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  54.23 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  55.03 
 
 		 317 aa  329  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  55.31 
 
 		 317 aa  329  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  54.23 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  54.23 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  54.23 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  54.37 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  57.32 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  54.09 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  54.09 
 
 		 317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  54.09 
 
 		 317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  54.09 
 
 		 317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  54.75 
 
 		 324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  54.72 
 
 		 317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  54.31 
 
 		 310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  54.09 
 
 		 317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  54.09 
 
 		 317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  54.09 
 
 		 338 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  54.09 
 
 		 317 aa  328  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  54.09 
 
 		 317 aa  328  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  54.72 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  54.72 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  54.72 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  53.75 
 
 		 318 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  54.72 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  55.31 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  54.23 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  56.88 
 
 		 322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  56.88 
 
 		 322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  53.92 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  54.72 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  54.55 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  54.06 
 
 		 318 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  54.37 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>