More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74289 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_74289  transaldolase  100 
 
 		 323 aa  654    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.318947 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00240  transaldolase (AFU_orthologue; AFUA_5G09230)  66.25 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16977  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  64.56 
 
 		 323 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  60.37 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  60.37 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  61.06 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  60.75 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  59.26 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  59.57 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  59.5 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  59.56 
 
 		 316 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  59.94 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  57.28 
 
 		 316 aa  361  8e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  59.19 
 
 		 317 aa  361  9e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  57.94 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  57.94 
 
 		 318 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  57.28 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  57.94 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  58.95 
 
 		 319 aa  359  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  57.76 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  57.94 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  58.07 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  59.87 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  60.87 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  59.12 
 
 		 318 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  56.27 
 
 		 334 aa  358  8e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  57.63 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  57.68 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  57.45 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  57.45 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  59.22 
 
 		 317 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  55.25 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  58.6 
 
 		 317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  57.41 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  57.59 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  56.39 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  56.39 
 
 		 315 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  56.07 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.62 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  57.1 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1779  transaldolase B  57.32 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  60.19 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  56.97 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.7 
 
 		 390 aa  348  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.51 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.39 
 
 		 390 aa  348  9e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  58.81 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  56.47 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  59.87 
 
 		 333 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  57.93 
 
 		 316 aa  345  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05831  transaldolase B  59.22 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.675554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  56.52 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  59.15 
 
 		 316 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  55.9 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  55.73 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  58.52 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  56.7 
 
 		 316 aa  342  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05761  transaldolase B  56.21 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  55.62 
 
 		 324 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1851  transaldolase B  56.21 
 
 		 332 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  55.76 
 
 		 310 aa  341  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  55.52 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  56.87 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  56.55 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  56.13 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  55.31 
 
 		 307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  55.45 
 
 		 315 aa  339  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  56.55 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05451  transaldolase B  57.93 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  56.73 
 
 		 339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  57.41 
 
 		 315 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  55.56 
 
 		 319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  55.76 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0654  transaldolase B  58.2 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.0202899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  57.1 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  54.63 
 
 		 319 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  55.66 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  55.34 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4350  transaldolase B  52.63 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  55.34 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  55.34 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  56.82 
 
 		 317 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  55.45 
 
 		 316 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  57.19 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  56.86 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  56.86 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  56.86 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>