207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0429 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  73.29 
 
 		 313 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  74.14 
 
 		 308 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  73.06 
 
 		 321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  71.29 
 
 		 321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  70.51 
 
 		 313 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  67.93 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  67.59 
 
 		 300 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  59.93 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  60.14 
 
 		 297 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  61.27 
 
 		 296 aa  338  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  59.06 
 
 		 290 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  31.83 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  32.36 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.22 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  30.11 
 
 		 364 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 		 336 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 336 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 327 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  27.74 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  29.74 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  29.47 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 341 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  26.92 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  30.99 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.62 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  30.38 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  30.38 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 		 470 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  30.41 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.27 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  30.41 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  30.03 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.12 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  25.52 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  29.51 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 470 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  30.03 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  29.19 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  30.03 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  30.46 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.69 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  28.07 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  26.62 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.2 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.72 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  29.72 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  24.68 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  29.79 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  27.43 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  26.39 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>