118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01432 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 329 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  88.15 
 
 		 329 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  69.51 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  60.37 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  53.05 
 
 		 323 aa  348  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  51.83 
 
 		 323 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  55.94 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  55.21 
 
 		 320 aa  340  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  55.21 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.21 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  55.21 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  55.21 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  55.21 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  51.68 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  51.68 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  51.68 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  54.91 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  55.62 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  54.6 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  54.29 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  54.29 
 
 		 320 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  53.99 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  51.99 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  52.13 
 
 		 322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  52 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  54.32 
 
 		 321 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  54.29 
 
 		 320 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  50.91 
 
 		 322 aa  311  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  32.16 
 
 		 351 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  31.67 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  32.24 
 
 		 349 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  31.34 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  32.34 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  31.21 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  33.62 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  34.72 
 
 		 366 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  34.95 
 
 		 366 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  32.04 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  33.01 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  32.95 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  29.54 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  32.37 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  30.56 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  33.03 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.91 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.05 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.41 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.85 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.85 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.61 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.67 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.82 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  23.78 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.42 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.63 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.62 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  27.12 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.59 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.3 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  30.15 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.59 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.11 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.75 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.35 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.41 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.08 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  27.36 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.44 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.07 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.22 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  25.18 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  25.18 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  24.91 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.55 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.25 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  24.34 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  27.51 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  24.59 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.05 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.66 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.66 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2968  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  24.23 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.708756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  27.57 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  23.86 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.05 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.32 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.27 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.66 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  25.81 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  26.11 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.67 
 
 		 422 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.44 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  25.62 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.44 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1635  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.66 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.5 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.099364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>