More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001382 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  75.12 
 
 		 436 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  100 
 
 		 523 aa  1067    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.88 
 
 		 531 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  37.02 
 
 		 557 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  33.52 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  32.76 
 
 		 531 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  37.72 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  34.64 
 
 		 527 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  34.97 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  34.1 
 
 		 533 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  34.09 
 
 		 526 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.87 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  37.33 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  34.22 
 
 		 535 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  33.33 
 
 		 534 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  35.85 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  33.59 
 
 		 548 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  30.95 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  33.01 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  36.56 
 
 		 535 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  33.4 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  33.27 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  32.43 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  32.43 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  35.05 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 558 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  32.88 
 
 		 550 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 		 534 aa  249  7e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  31.49 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  33.46 
 
 		 546 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  31.64 
 
 		 525 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  33.07 
 
 		 527 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  33.33 
 
 		 546 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  31.93 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  33.33 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  33.33 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  33.33 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  29.56 
 
 		 535 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  30.51 
 
 		 524 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  32.15 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  30.21 
 
 		 545 aa  233  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  31.78 
 
 		 531 aa  233  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 548 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  29.1 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  30 
 
 		 529 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  32.58 
 
 		 529 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  32.02 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  30.4 
 
 		 549 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 529 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  32.65 
 
 		 565 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  30.71 
 
 		 555 aa  223  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  29.75 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  30.5 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  29.87 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  28.65 
 
 		 548 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  31.07 
 
 		 516 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.3 
 
 		 641 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  29.81 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  29.28 
 
 		 645 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.94 
 
 		 630 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  30.5 
 
 		 635 aa  200  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 524 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.75 
 
 		 644 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 		 636 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  31.19 
 
 		 569 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 		 644 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  29.22 
 
 		 639 aa  187  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 		 640 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 		 658 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 658 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  28.75 
 
 		 672 aa  186  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.33 
 
 		 643 aa  186  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 644 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.44 
 
 		 659 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 		 662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.44 
 
 		 658 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.44 
 
 		 658 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  31.96 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  26.35 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 644 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  31.26 
 
 		 635 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.81 
 
 		 634 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  27.61 
 
 		 690 aa  183  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  28.83 
 
 		 625 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  30.05 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.37 
 
 		 642 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.37 
 
 		 642 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>