137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001063 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  100 
 
 
580 aa  1210    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  44.97 
 
 
684 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  46.75 
 
 
586 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  44.15 
 
 
576 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  42.21 
 
 
584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  42.83 
 
 
586 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  36.75 
 
 
610 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  37.41 
 
 
613 aa  356  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  34.47 
 
 
599 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  30.68 
 
 
628 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  30.86 
 
 
594 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  31.63 
 
 
519 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  29.48 
 
 
555 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.21 
 
 
610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  29.06 
 
 
578 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.22 
 
 
1148 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  28.03 
 
 
606 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  25.65 
 
 
609 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  27.43 
 
 
611 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.92 
 
 
608 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  26.12 
 
 
578 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  26.12 
 
 
578 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  28.82 
 
 
594 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  28.82 
 
 
594 aa  156  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  27.13 
 
 
596 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  26.35 
 
 
591 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  28.82 
 
 
595 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.08 
 
 
602 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  27.08 
 
 
602 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  27.08 
 
 
602 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  27.08 
 
 
602 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.94 
 
 
584 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  26.24 
 
 
593 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.02 
 
 
602 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  26.09 
 
 
645 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  25.81 
 
 
602 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.43 
 
 
602 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  28.25 
 
 
601 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27 
 
 
1153 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  25.74 
 
 
602 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  24.29 
 
 
601 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.36 
 
 
925 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 
570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.6 
 
 
574 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  24 
 
 
574 aa  123  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  27.1 
 
 
590 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 
590 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  26.68 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  23.76 
 
 
574 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.09 
 
 
810 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  25.47 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  22.91 
 
 
818 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  25.11 
 
 
672 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.07 
 
 
592 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.07 
 
 
592 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.26 
 
 
655 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.43 
 
 
560 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25 
 
 
655 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  25.3 
 
 
653 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  25 
 
 
720 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  25.65 
 
 
656 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  25.65 
 
 
656 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  24.21 
 
 
991 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.15 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  21.96 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  21.96 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.36 
 
 
588 aa  77.4  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 
998 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 
615 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.58 
 
 
562 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.41 
 
 
578 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  22.65 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  24.43 
 
 
998 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  21.82 
 
 
842 aa  74.7  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  23.69 
 
 
577 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  22.03 
 
 
813 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.15 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  21.49 
 
 
585 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  21.49 
 
 
585 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  24.1 
 
 
625 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  21.41 
 
 
601 aa  71.2  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  23.48 
 
 
617 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  23.33 
 
 
639 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  20.89 
 
 
621 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  21.28 
 
 
599 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  20.32 
 
 
618 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  21.41 
 
 
614 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  20.98 
 
 
621 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  21.14 
 
 
608 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  20.2 
 
 
615 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  20.91 
 
 
619 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  22.47 
 
 
582 aa  60.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  19.83 
 
 
601 aa  60.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  21.12 
 
 
610 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  21.12 
 
 
610 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  21.12 
 
 
612 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  21.24 
 
 
799 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.12 
 
 
610 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.69 
 
 
612 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.02 
 
 
612 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>