More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1742 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  100 
 
 		 354 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  85.55 
 
 		 357 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  86.4 
 
 		 356 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  76.29 
 
 		 355 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  58.86 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  59.08 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  57.91 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  58.5 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  57.91 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  57.91 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  57.91 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  58.5 
 
 		 353 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  58.79 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  58.79 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  58.79 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  57.79 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  56.48 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  53.48 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  54.99 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  54.34 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  53.31 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  54.31 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  53.26 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  55.06 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  55.84 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  56.3 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  54.21 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  54.21 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  56.09 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  50.85 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  53.65 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  54.67 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  54.67 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  54.67 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  54.67 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  53.93 
 
 		 361 aa  342  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  54.49 
 
 		 361 aa  342  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  52 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  47.52 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  54.65 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  50.87 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  48.06 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  51.85 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  53.24 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  53.24 
 
 		 357 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  49 
 
 		 372 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  52.84 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  47.59 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  51.84 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  52.27 
 
 		 356 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.84 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  46.59 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  50.71 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  50.71 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  45.4 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  49.43 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  50.42 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  45.48 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  50.99 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  42.44 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  48.12 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  48.12 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  40.91 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 351 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.32 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.28 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.45 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.45 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.42 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  26.2 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  31.49 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  29.6 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.86 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.86 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  30.89 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.81 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.81 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.81 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.81 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.81 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.81 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.58 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.57 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  28.95 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.61 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.67 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.62 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>