99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1121 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  41.24 
 
 		 232 aa  157  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 253 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  39.06 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  39.06 
 
 		 215 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  36.51 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  36.87 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  33.9 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  33.15 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  34.52 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  36.02 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  31.69 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  31.25 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  27.57 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  27.57 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  27.22 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  28.23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.99 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  26.63 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  24.7 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.1 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 168 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  26.4 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  26.04 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  26.74 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  23.98 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  27.38 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.41 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 108 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  29.09 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  25.56 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  26.79 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  31.65 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  34.07 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  22.03 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  23.16 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  25.15 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  29.32 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  21.86 
 
 		 218 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  28.41 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  23.49 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 177 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  25.42 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>