119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0925 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  100 
 
 		 696 aa  1401    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  68.51 
 
 		 684 aa  848    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  26.75 
 
 		 654 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  33.98 
 
 		 895 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  31.28 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  54.72 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  30.22 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  27.96 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  52.54 
 
 		 759 aa  57  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  32.84 
 
 		 930 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  28.26 
 
 		 451 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  60.53 
 
 		 867 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  28.7 
 
 		 453 aa  54.7  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  25.58 
 
 		 718 aa  54.7  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  25.91 
 
 		 718 aa  54.7  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  26.44 
 
 		 446 aa  54.3  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  26.44 
 
 		 446 aa  54.3  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  29.05 
 
 		 473 aa  54.3  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  30.29 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  34.15 
 
 		 739 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  26.37 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  52.17 
 
 		 312 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  26.82 
 
 		 446 aa  53.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  30.53 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  30.53 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  29.71 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0695  DNA repair protein RadA  30.99 
 
 		 450 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  27.56 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  28.02 
 
 		 454 aa  52  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  29.83 
 
 		 456 aa  51.6  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  28.36 
 
 		 457 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  25.96 
 
 		 446 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  26.11 
 
 		 457 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  30.51 
 
 		 457 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  27.6 
 
 		 457 aa  50.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  26.89 
 
 		 462 aa  50.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  28.5 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  50 
 
 		 309 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  27.68 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  28.91 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  28.18 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  27.06 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  27.51 
 
 		 464 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  26.4 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  27.93 
 
 		 446 aa  50.4  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25.38 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  27.31 
 
 		 464 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  29.35 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  28.91 
 
 		 466 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  27.84 
 
 		 476 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  27.68 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  28.91 
 
 		 466 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  25.47 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  54.05 
 
 		 868 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  54.05 
 
 		 868 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  54.05 
 
 		 868 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  46.3 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  32.07 
 
 		 453 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  27.03 
 
 		 734 aa  49.3  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  24.34 
 
 		 450 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  26.79 
 
 		 467 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  32 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  31.67 
 
 		 458 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  27.37 
 
 		 457 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  26.89 
 
 		 453 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  26.63 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  22.77 
 
 		 469 aa  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  24 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  31.61 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  27.08 
 
 		 467 aa  48.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  27.08 
 
 		 467 aa  48.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  25.5 
 
 		 446 aa  48.1  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  31.18 
 
 		 682 aa  47.8  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4095  DNA repair protein RadA  27.97 
 
 		 452 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0497  DNA repair protein RadA  27.72 
 
 		 422 aa  47.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  24.11 
 
 		 450 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  50 
 
 		 725 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  25.99 
 
 		 452 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  27.32 
 
 		 481 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  31.07 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2110  DNA repair protein RadA  26.34 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  25.7 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  25.47 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  26.9 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  30.9 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  27.32 
 
 		 476 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  26.97 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  34.44 
 
 		 979 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  55.26 
 
 		 147 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  25.59 
 
 		 458 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1854  DNA repair protein RadA  28.16 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  31.52 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  26.86 
 
 		 460 aa  45.8  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  27.6 
 
 		 462 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  41.67 
 
 		 283 aa  45.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  25.28 
 
 		 446 aa  45.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  30.34 
 
 		 468 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>