282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0344 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
211 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
211 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 
217 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
211 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  34.98 
 
 
212 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
229 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
215 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
209 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
214 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
214 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.02 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  29.66 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  32.2 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  31.71 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
215 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 
230 aa  87  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  34.98 
 
 
202 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  29.76 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  30.62 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
412 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
448 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.94 
 
 
369 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.61 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.45 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
448 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
445 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.5 
 
 
378 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
440 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.06 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  29.32 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 
233 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 
459 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.05 
 
 
378 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.08 
 
 
356 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.67 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.67 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.75 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.95 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
447 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.89 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
401 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.95 
 
 
547 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.42 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.75 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
452 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>