273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0158 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
450 aa  928    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.7 
 
 
455 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.45 
 
 
451 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.43 
 
 
367 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.68 
 
 
427 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  54.39 
 
 
371 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.16 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.45 
 
 
388 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.01 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.86 
 
 
460 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.62 
 
 
392 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  45.09 
 
 
422 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.73 
 
 
396 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.89 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.87 
 
 
387 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  45.48 
 
 
461 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  38.72 
 
 
475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.89 
 
 
442 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  41.18 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  38 
 
 
471 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  42.78 
 
 
419 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  39.68 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  34.31 
 
 
766 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.06 
 
 
520 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.83 
 
 
570 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
676 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  37.96 
 
 
469 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  34.83 
 
 
875 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  40.49 
 
 
488 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  33.25 
 
 
748 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.78 
 
 
2172 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.88 
 
 
1657 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  38.71 
 
 
342 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.95 
 
 
1029 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  32.57 
 
 
841 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  32.98 
 
 
712 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.95 
 
 
561 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.95 
 
 
999 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.65 
 
 
585 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29 
 
 
428 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  32.39 
 
 
999 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  32.39 
 
 
999 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.79 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 
432 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 
392 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  31.03 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.72 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  29.17 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.63 
 
 
972 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.73 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  30.16 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.73 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.73 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.69 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  26.1 
 
 
370 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 
378 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  42.47 
 
 
192 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 
377 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 
892 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  28.93 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.4 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.84 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  29.26 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  31.98 
 
 
374 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 
381 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 
367 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  28.25 
 
 
388 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  27.24 
 
 
383 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.17 
 
 
387 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 
372 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.23 
 
 
408 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  29.57 
 
 
462 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  31.62 
 
 
394 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 
368 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 
405 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.35 
 
 
388 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  28.53 
 
 
382 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  31.29 
 
 
387 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.99 
 
 
1132 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
369 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  28.18 
 
 
381 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 
382 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  25.07 
 
 
394 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 
418 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 
366 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  29.25 
 
 
383 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  29.67 
 
 
387 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 
394 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  29 
 
 
381 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  33.48 
 
 
908 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  24.93 
 
 
395 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.76 
 
 
373 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 
386 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.51 
 
 
371 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>