More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0073 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  734    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  50.84 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  47.62 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  48.19 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  49.17 
 
 		 356 aa  335  5e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  46.67 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  46.11 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  34.57 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  48.54 
 
 		 270 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 372 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  33.06 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  33.6 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  47.67 
 
 		 102 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 461 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.29 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  25.15 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.55 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.51 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 457 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  23.38 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.87 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  22.49 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  20.51 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  24.54 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  33.97 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 496 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  21.37 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.21 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>