60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2992 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  769    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  58.01 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  59 
 
 		 472 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  51.48 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  49.63 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.17 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  30.22 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28.75 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  28.49 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  27.23 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  23.06 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  25.83 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  25.83 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.93 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  27.42 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  25.73 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  28.07 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>