More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0247 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  75.48 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  69.43 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  38.83 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  38.14 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  39.51 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  32.9 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  48.05 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 277 aa  57.4  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 277 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 240 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  39.24 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  32.8 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  33.62 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  37.39 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 325 aa  53.9  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  34.31 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 268 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  39.02 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  42.31 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  36.67 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  40.66 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 277 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  33.72 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>