More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1305 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  57.53 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  50.68 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  51.39 
 
 		 225 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  52.8 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  49.54 
 
 		 286 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  51.92 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  48.15 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  50.68 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  52.09 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  47.44 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  46.82 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  47.71 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  49.09 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  49.09 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  47.47 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  47.44 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  47.44 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  48.62 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  42.79 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  48.61 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  46.51 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  47.87 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  45.62 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  45.12 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  47.91 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  45.41 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  46.08 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  45.33 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  44.44 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  44.44 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  39.81 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  46.08 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  44.44 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  44.91 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  42.2 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  44.91 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  44.91 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  45.87 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  45.16 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  43.72 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  38.53 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  40.28 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  37.04 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  46.06 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  39.6 
 
 		 429 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  36.28 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 		 251 aa  147  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.09 
 
 		 443 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  35.56 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  33.02 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 405 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  39.32 
 
 		 402 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 390 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  40.98 
 
 		 424 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  38.46 
 
 		 390 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  37.93 
 
 		 416 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  35.68 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 429 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  37.44 
 
 		 438 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.02 
 
 		 421 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  38.89 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  35 
 
 		 433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  39.29 
 
 		 472 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.02 
 
 		 421 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0520  ABC transporter related  36.24 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  39.9 
 
 		 416 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  39.78 
 
 		 405 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  36.74 
 
 		 392 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  36.63 
 
 		 435 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.2 
 
 		 455 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.6 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  38.12 
 
 		 498 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  37.61 
 
 		 422 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  38.46 
 
 		 406 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  38.5 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  36.45 
 
 		 424 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 465 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 465 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 465 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 465 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 471 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.58 
 
 		 456 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 469 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 465 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  36.63 
 
 		 472 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>