More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0623 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  100 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  66.2 
 
 		 217 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.82 
 
 		 220 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.82 
 
 		 220 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.82 
 
 		 220 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  55.75 
 
 		 225 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  57.08 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 		 223 aa  273  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  56.36 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  55.35 
 
 		 218 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  50.7 
 
 		 217 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  48.61 
 
 		 216 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  48.15 
 
 		 229 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  48.15 
 
 		 221 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  48.61 
 
 		 216 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  49.54 
 
 		 220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 218 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  50.22 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 		 273 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  46.76 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  46.76 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  46.3 
 
 		 233 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  46.3 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  46.3 
 
 		 217 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  44.59 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  44.5 
 
 		 219 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  44.65 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  44.91 
 
 		 217 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  44.91 
 
 		 217 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  43.98 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  43.98 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  46.3 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  43.98 
 
 		 217 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 		 217 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  47.47 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  47.47 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  42.13 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  43.06 
 
 		 215 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  42.59 
 
 		 217 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  40.72 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  40.72 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  42.2 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  41.51 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  39.17 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  41.86 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 218 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 218 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 218 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 218 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  36.94 
 
 		 219 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  37.79 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  37.5 
 
 		 217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  37.04 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  35.19 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  40.76 
 
 		 455 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  51.61 
 
 		 179 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  37.44 
 
 		 429 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  41.29 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  36.52 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  34.18 
 
 		 397 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  34.18 
 
 		 397 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  33.19 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  36.59 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  38.92 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 390 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  37.22 
 
 		 235 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  39.52 
 
 		 407 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  34.72 
 
 		 219 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.62 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  37.3 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  38.24 
 
 		 430 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  36.36 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  36.32 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  34.51 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  39.39 
 
 		 439 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  36.95 
 
 		 424 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  36.28 
 
 		 422 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 440 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  35.14 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  38.38 
 
 		 424 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  36.19 
 
 		 408 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  36.79 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  38.66 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  38.66 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  38.54 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  37.5 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  36.87 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  34.39 
 
 		 415 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  33.19 
 
 		 549 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 393 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 393 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0520  ABC transporter related  37.75 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  35.96 
 
 		 424 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  37.44 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>