More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02827 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  99.54 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  70.28 
 
 		 219 aa  321  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  57.62 
 
 		 217 aa  274  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  56.36 
 
 		 286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  56.19 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 		 220 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 		 220 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  52.63 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  51.92 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  49.04 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  49.28 
 
 		 273 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  49.28 
 
 		 269 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  49.75 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  46.67 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  45.54 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  45.24 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  45.24 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  44.08 
 
 		 216 aa  207  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  45.71 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  45.24 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  48.57 
 
 		 216 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  43.54 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  51.3 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  51.3 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  43.54 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  45.45 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  45.24 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  44.76 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  42.72 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  46.89 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  44.06 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  43.81 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  43.33 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  43.75 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  43.75 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  43.75 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  42.25 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  40.58 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  42.93 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  41.98 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  40.67 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  38.39 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  36.19 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  40.09 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  48.73 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.12 
 
 		 429 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  40.33 
 
 		 435 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  40.21 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  35.75 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  35.68 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  37.31 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  39.68 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  37.5 
 
 		 435 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  41.94 
 
 		 649 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 396 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  40.23 
 
 		 455 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  39.9 
 
 		 425 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  40 
 
 		 436 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  40.44 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  36.36 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  37.97 
 
 		 423 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  39.67 
 
 		 422 aa  142  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 405 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  36.36 
 
 		 430 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  40.66 
 
 		 402 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  38.24 
 
 		 416 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 549 aa  141  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  38.3 
 
 		 416 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 390 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.13 
 
 		 390 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  37.17 
 
 		 405 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  38.69 
 
 		 438 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  41.34 
 
 		 456 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  39.8 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  35.96 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.87 
 
 		 432 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  36.7 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 415 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  36.54 
 
 		 435 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 440 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  38.5 
 
 		 254 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  34.95 
 
 		 446 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  36.36 
 
 		 248 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.7 
 
 		 421 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  37.91 
 
 		 406 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 418 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  39.38 
 
 		 427 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>