More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3867 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  68.54 
 
 
217 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  67.61 
 
 
222 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  68.08 
 
 
217 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  64.52 
 
 
218 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  64.52 
 
 
218 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  64.52 
 
 
218 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  64.52 
 
 
218 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  64.62 
 
 
218 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  64.62 
 
 
218 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  62.44 
 
 
216 aa  288  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  63.26 
 
 
217 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  63.26 
 
 
217 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  57.89 
 
 
232 aa  265  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  56.54 
 
 
217 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  55.14 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
224 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  54.46 
 
 
215 aa  247  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  48.08 
 
 
220 aa  228  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  51.64 
 
 
221 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  46.63 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  47.66 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  47.17 
 
 
217 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
218 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  64.94 
 
 
157 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  48.13 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  48.13 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  48.6 
 
 
217 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  47.66 
 
 
233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  46.26 
 
 
216 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  43.26 
 
 
217 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  44.95 
 
 
219 aa  208  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  45.79 
 
 
218 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  42.86 
 
 
229 aa  201  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  43.46 
 
 
217 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  42.65 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  42.06 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  43.06 
 
 
286 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  40.85 
 
 
269 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
273 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  42.73 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  42.42 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  37.79 
 
 
219 aa  187  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  41.28 
 
 
218 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  41.86 
 
 
220 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  40.85 
 
 
225 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  40.85 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  41.12 
 
 
217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  41.59 
 
 
216 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  41.28 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  40 
 
 
224 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  37.38 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  38.53 
 
 
219 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  35.78 
 
 
219 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  38.27 
 
 
410 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.58 
 
 
264 aa  147  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.58 
 
 
264 aa  147  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.86 
 
 
264 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.68 
 
 
264 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  37.38 
 
 
266 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  39.15 
 
 
429 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.35 
 
 
429 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  37.81 
 
 
424 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  34.76 
 
 
392 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  36.45 
 
 
406 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  37 
 
 
405 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  39.39 
 
 
446 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  34.33 
 
 
238 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  36 
 
 
402 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  32.87 
 
 
230 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.36 
 
 
432 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.8 
 
 
456 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 
440 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  38.24 
 
 
430 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.71 
 
 
549 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  36.5 
 
 
405 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.25 
 
 
649 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  36.36 
 
 
455 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  37.56 
 
 
406 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  36.71 
 
 
416 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  37.56 
 
 
424 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
415 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  35.78 
 
 
421 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  35.89 
 
 
412 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  35.96 
 
 
421 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  37.56 
 
 
429 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  36.22 
 
 
443 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 
393 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 
393 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  39.34 
 
 
264 aa  134  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 
410 aa  134  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  37.81 
 
 
435 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  38.8 
 
 
400 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  35.2 
 
 
438 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  35.47 
 
 
416 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>