More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1524 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  100 
 
 		 216 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  65.28 
 
 		 217 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  65.42 
 
 		 218 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  65.42 
 
 		 218 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  62.62 
 
 		 217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  63.55 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  63.55 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  63.55 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  63.55 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  62.15 
 
 		 222 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  62.44 
 
 		 217 aa  288  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  57.41 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  57.01 
 
 		 232 aa  271  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 224 aa  265  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  57.48 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  57.48 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  56.13 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  54.25 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  49.06 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  46.01 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  49.77 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  47.37 
 
 		 220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  47.22 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  62.09 
 
 		 157 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  47.66 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  47.66 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  48.36 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  46.73 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  47.66 
 
 		 216 aa  211  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  47.17 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  45.37 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  45.37 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  43.98 
 
 		 286 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  45.91 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  45.24 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  41.67 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  41.67 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  42.58 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  40.28 
 
 		 269 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  41.31 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  41.12 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  40.65 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  39.25 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  41.55 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  42.2 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  40.65 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  39.53 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  38.14 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  39.63 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  38.03 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  40.95 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  38.78 
 
 		 443 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  36.41 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  35.48 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  36.77 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  34.45 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  38 
 
 		 422 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.12 
 
 		 264 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.61 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  38.81 
 
 		 400 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37 
 
 		 549 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  39.5 
 
 		 415 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  40 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37 
 
 		 549 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37 
 
 		 549 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.81 
 
 		 393 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.81 
 
 		 393 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36.5 
 
 		 549 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  35.48 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.81 
 
 		 429 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  35.82 
 
 		 438 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.89 
 
 		 432 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  38.81 
 
 		 436 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  39.89 
 
 		 390 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  37.68 
 
 		 430 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  39.3 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  40.62 
 
 		 179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  38.61 
 
 		 405 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 415 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  33.94 
 
 		 449 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.63 
 
 		 264 aa  138  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  38.07 
 
 		 431 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  38.73 
 
 		 427 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  36.95 
 
 		 427 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34 
 
 		 454 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  38.86 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  38.31 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  37.56 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  36.41 
 
 		 464 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  40.44 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  36.18 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>