More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3251 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  99.36 
 
 
157 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  66.36 
 
 
217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  64.52 
 
 
217 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  65.89 
 
 
217 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  63.55 
 
 
216 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  65.57 
 
 
218 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  65.57 
 
 
218 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  63.26 
 
 
222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  56.28 
 
 
232 aa  265  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  57.48 
 
 
217 aa  257  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 
217 aa  254  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  58.06 
 
 
217 aa  254  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  56.28 
 
 
215 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  55.35 
 
 
215 aa  245  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  53.05 
 
 
224 aa  240  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  46.76 
 
 
220 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  50 
 
 
220 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  47 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  48.15 
 
 
216 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  45.79 
 
 
218 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  48.86 
 
 
221 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  47.17 
 
 
218 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  45.37 
 
 
217 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  47 
 
 
217 aa  201  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  47 
 
 
217 aa  201  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  46.08 
 
 
233 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  43.54 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  40.55 
 
 
269 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
273 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  41.74 
 
 
225 aa  188  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  41.74 
 
 
225 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  39.91 
 
 
225 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  43.4 
 
 
229 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  42.59 
 
 
216 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  42.66 
 
 
217 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  41.74 
 
 
217 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  40 
 
 
217 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
220 aa  181  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
220 aa  181  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  40.48 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  42.51 
 
 
219 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
220 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  40.74 
 
 
220 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  41.67 
 
 
286 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  37.98 
 
 
219 aa  174  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  40.47 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  38.36 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  39.63 
 
 
221 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  38.97 
 
 
217 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  35.21 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  41.61 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  35.32 
 
 
230 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.5 
 
 
264 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.5 
 
 
264 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  34.74 
 
 
219 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  39.59 
 
 
266 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.56 
 
 
264 aa  141  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  34.26 
 
 
410 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  37.31 
 
 
498 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  38.5 
 
 
400 aa  139  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  33.8 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 
390 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.35 
 
 
390 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.62 
 
 
456 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  36.62 
 
 
238 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  38.46 
 
 
464 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  35.82 
 
 
443 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  36.32 
 
 
711 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  35.96 
 
 
416 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  36.54 
 
 
394 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 
440 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  38.42 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  34.1 
 
 
432 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  35.53 
 
 
455 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.55 
 
 
264 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  33.5 
 
 
549 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  35.86 
 
 
252 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  40.56 
 
 
429 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
393 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
393 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  33.98 
 
 
402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  37.62 
 
 
472 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  34.45 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  37.24 
 
 
424 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  36.99 
 
 
249 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  37.95 
 
 
392 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  38.22 
 
 
243 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  36.5 
 
 
436 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.63 
 
 
405 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  35.32 
 
 
405 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  35.5 
 
 
418 aa  128  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  33.67 
 
 
488 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  40.11 
 
 
427 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  37.32 
 
 
430 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>