More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0434 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  94.47 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  72.22 
 
 		 217 aa  341  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  65.28 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  65.28 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  64.35 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  53.27 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  49.07 
 
 		 216 aa  238  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  46.73 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  47.42 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  46.54 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  46.51 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  46.51 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  49.3 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  45.83 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  46.54 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  45.12 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  43.33 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  44.5 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  45.07 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  44.6 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  43.81 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  42.4 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  45.16 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  44.65 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  42.59 
 
 		 286 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  41.86 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  44.39 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  41.86 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  42.45 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  42.45 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  41.12 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  41.94 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  39.45 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  44.44 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  41.31 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  39.07 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  38.99 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  39.91 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  37.79 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  37.16 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  46.1 
 
 		 179 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.19 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  36.92 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  34.26 
 
 		 421 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  34.26 
 
 		 421 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  35.61 
 
 		 416 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  34.3 
 
 		 478 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  32.76 
 
 		 438 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.18 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  33.67 
 
 		 432 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  33.33 
 
 		 424 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  36.07 
 
 		 406 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  31.19 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  32.29 
 
 		 408 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  34.18 
 
 		 424 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  31.78 
 
 		 406 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  32.5 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  31.82 
 
 		 394 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  32.99 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  35.39 
 
 		 437 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  32.2 
 
 		 247 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  33.19 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  35.1 
 
 		 410 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  34.87 
 
 		 472 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  33.5 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  32 
 
 		 402 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  31.68 
 
 		 429 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  32.42 
 
 		 420 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  32.51 
 
 		 429 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  32.32 
 
 		 498 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  34.12 
 
 		 412 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  33.33 
 
 		 427 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  34.62 
 
 		 439 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  32.56 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  33 
 
 		 405 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.11 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  32.84 
 
 		 457 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  29 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  33.33 
 
 		 437 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>