More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1620 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  95.91 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 
223 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  56.82 
 
 
286 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  56.22 
 
 
217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  54.63 
 
 
218 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  57.34 
 
 
225 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  58.26 
 
 
219 aa  248  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  56.6 
 
 
219 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  46.3 
 
 
221 aa  218  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  46.79 
 
 
216 aa  214  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  49.77 
 
 
220 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  46.15 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  47.47 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 
217 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  45.16 
 
 
217 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  45.16 
 
 
217 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  47.69 
 
 
217 aa  208  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  44.7 
 
 
233 aa  204  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 
273 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  44.24 
 
 
269 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  45.83 
 
 
219 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  44.24 
 
 
216 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  45 
 
 
217 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  45 
 
 
217 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  42.4 
 
 
219 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  47.42 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  42.66 
 
 
220 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  42.4 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  42.4 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  42.86 
 
 
217 aa  194  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  42.4 
 
 
218 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  45.16 
 
 
217 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  41.67 
 
 
220 aa  188  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  42.4 
 
 
217 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  41.94 
 
 
217 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  43.52 
 
 
221 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  43.78 
 
 
217 aa  185  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  44.04 
 
 
215 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  43.32 
 
 
222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  42.4 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
218 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
218 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
218 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
218 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  42.86 
 
 
216 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  42.59 
 
 
218 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  42.59 
 
 
218 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  41.47 
 
 
215 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  38.25 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  35.68 
 
 
230 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 
251 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  33.49 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
253 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  34.68 
 
 
217 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.58 
 
 
649 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  37.17 
 
 
266 aa  141  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  33.33 
 
 
261 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  35.29 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  35.57 
 
 
405 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
296 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  33.05 
 
 
549 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  32.38 
 
 
246 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 
390 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  33.7 
 
 
455 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  33.91 
 
 
390 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  34.05 
 
 
435 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  31.65 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  34.34 
 
 
424 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  35.87 
 
 
440 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  33.33 
 
 
478 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  33.5 
 
 
416 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  33.33 
 
 
235 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  34.85 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  34.05 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  34.56 
 
 
430 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  34.34 
 
 
424 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  36.04 
 
 
427 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  30.9 
 
 
392 aa  134  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  33.67 
 
 
433 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  32.74 
 
 
402 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  35.23 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  33.33 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  36.27 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  32.19 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  33.68 
 
 
405 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  32.83 
 
 
408 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  33 
 
 
424 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  33.68 
 
 
425 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
157 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  31.82 
 
 
450 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  32.63 
 
 
246 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  32.32 
 
 
422 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  33.51 
 
 
416 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 
471 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 
469 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>