More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0660 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  60.85 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  60.85 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  60.75 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  58.41 
 
 		 217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  59.52 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  57.21 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  55.81 
 
 		 232 aa  251  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  56.13 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  55.3 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  55.39 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  53.27 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  45.12 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  44.81 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  50.46 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  50.46 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  50.46 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  49.54 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  46.05 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  48.57 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  44.86 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  45.97 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  44.19 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  46.48 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  58.55 
 
 		 157 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  44.65 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  40.74 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  44.29 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  43.19 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  40.93 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  39.44 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  40.67 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  42.13 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  41.86 
 
 		 286 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  41.67 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  42.06 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  38.89 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  40.64 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  38.6 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  39.63 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  35.05 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  34.27 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.82 
 
 		 432 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  34.27 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  33.03 
 
 		 410 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  34.36 
 
 		 247 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  35.9 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  33.64 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  39.38 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 390 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 393 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 393 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  32.48 
 
 		 390 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  36.06 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  37.88 
 
 		 446 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  32.72 
 
 		 711 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  33.02 
 
 		 264 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  37.88 
 
 		 435 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  36.68 
 
 		 498 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.3 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  35.32 
 
 		 422 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  38.46 
 
 		 472 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  31.31 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  37.56 
 
 		 429 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  34.69 
 
 		 438 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  34.4 
 
 		 429 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  31.43 
 
 		 549 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  31.43 
 
 		 549 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  35.58 
 
 		 416 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  31.43 
 
 		 549 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  32.65 
 
 		 549 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  37.89 
 
 		 429 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 		 440 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 429 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  34.4 
 
 		 472 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 405 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  39.15 
 
 		 437 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  35.75 
 
 		 400 aa  124  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  35.5 
 
 		 418 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  34.12 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  36.04 
 
 		 418 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  36.49 
 
 		 424 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  36.73 
 
 		 415 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  35.03 
 
 		 428 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  34.12 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  37.62 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>