More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3995 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  83.03 
 
 		 269 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  83.03 
 
 		 273 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  59.06 
 
 		 225 aa  214  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  58.48 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  60.39 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  53.59 
 
 		 219 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  53.29 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  50.33 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  47.2 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  47.47 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  47.8 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  47.17 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  47.17 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  48.7 
 
 		 217 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  46.1 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  46.2 
 
 		 221 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  51.61 
 
 		 286 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  48.73 
 
 		 219 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  48.73 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  42.68 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  45.64 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  42.94 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  46.85 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  50 
 
 		 219 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  42.77 
 
 		 216 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  42.41 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  46.06 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  42.95 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  42.04 
 
 		 218 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  42.04 
 
 		 218 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  40.62 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  41.03 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 220 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 217 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 220 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  42.76 
 
 		 217 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 220 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  42.76 
 
 		 217 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 223 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  40.36 
 
 		 232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  39.38 
 
 		 215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  40.27 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  40.94 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  42.36 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  40.37 
 
 		 221 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 217 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  41.22 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  41.14 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  37.25 
 
 		 219 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  35.71 
 
 		 219 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  36.81 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  37.95 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  40.14 
 
 		 402 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  34.94 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 		 440 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  34.15 
 
 		 472 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  35.48 
 
 		 410 aa  95.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.41 
 
 		 421 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.41 
 
 		 421 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  33.75 
 
 		 438 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  33.55 
 
 		 424 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  30.49 
 
 		 264 aa  93.6  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 405 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.64 
 
 		 287 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.76 
 
 		 397 aa  93.2  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 253 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  33.55 
 
 		 416 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  36.05 
 
 		 238 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  33.76 
 
 		 416 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  34.67 
 
 		 406 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  34.76 
 
 		 369 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  35.26 
 
 		 472 aa  92  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.86 
 
 		 478 aa  92  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  35.76 
 
 		 246 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  33.11 
 
 		 436 aa  91.7  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  38.85 
 
 		 400 aa  91.7  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 415 aa  91.3  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 549 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 549 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 549 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  33.99 
 
 		 429 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  39.29 
 
 		 254 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  35.46 
 
 		 443 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  38 
 
 		 416 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  37.18 
 
 		 488 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 448 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 390 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  34.84 
 
 		 390 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  35.71 
 
 		 424 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  32.54 
 
 		 420 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  34.16 
 
 		 428 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  36.42 
 
 		 249 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>