More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1505 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  56.81 
 
 
218 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  56.81 
 
 
218 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  57.14 
 
 
216 aa  265  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  57.75 
 
 
217 aa  264  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  54.46 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  52.53 
 
 
217 aa  257  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  55.77 
 
 
222 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  52.58 
 
 
217 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  55.81 
 
 
215 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 
218 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 
218 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 
218 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 
218 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  55.39 
 
 
215 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  52.2 
 
 
217 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  52.63 
 
 
232 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  52.94 
 
 
220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  51.18 
 
 
217 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 
217 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  46.48 
 
 
220 aa  218  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  50.7 
 
 
218 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  50.73 
 
 
233 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  50.73 
 
 
217 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  49.29 
 
 
286 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  50.73 
 
 
217 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  51.17 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  46.23 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  48.6 
 
 
221 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  49.51 
 
 
217 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
217 aa  207  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  47.8 
 
 
225 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  48.5 
 
 
219 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  46.01 
 
 
218 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 
220 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  46.23 
 
 
219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  45.07 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  45.64 
 
 
219 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  42.99 
 
 
219 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  42.86 
 
 
218 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  47.51 
 
 
220 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  44.06 
 
 
229 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  44.02 
 
 
217 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 
157 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  43.41 
 
 
217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  42.01 
 
 
216 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  42.72 
 
 
225 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  42.72 
 
 
225 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  41.04 
 
 
221 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  39.15 
 
 
224 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  38.32 
 
 
230 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  47.95 
 
 
179 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.31 
 
 
264 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  38.33 
 
 
416 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  37.17 
 
 
238 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  38.89 
 
 
266 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
390 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.02 
 
 
390 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  40 
 
 
435 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  32.9 
 
 
264 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  32.9 
 
 
264 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  35.05 
 
 
217 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
393 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
393 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  35.98 
 
 
219 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  36.22 
 
 
219 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  38.02 
 
 
455 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  37.98 
 
 
418 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  38.6 
 
 
436 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.5 
 
 
397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 
440 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.95 
 
 
549 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  38.58 
 
 
234 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.35 
 
 
418 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  34.72 
 
 
219 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  37.69 
 
 
418 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 
418 aa  139  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  36.02 
 
 
438 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  35.41 
 
 
711 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  36.19 
 
 
422 aa  139  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  39.2 
 
 
424 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  39.89 
 
 
250 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.37 
 
 
549 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
433 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.14 
 
 
549 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.37 
 
 
549 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  38.42 
 
 
427 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  36.23 
 
 
437 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  39.23 
 
 
430 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  36.14 
 
 
422 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  39.89 
 
 
235 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.8 
 
 
454 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  35.81 
 
 
428 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  38.19 
 
 
431 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 
422 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>