More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0774 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  98.62 
 
 		 233 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  75.58 
 
 		 217 aa  357  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  65.28 
 
 		 217 aa  315  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  65.28 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  55.14 
 
 		 218 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  53.7 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  48.61 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  52.34 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  52.07 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  47.69 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  49.07 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  47.85 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  46.95 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  50.69 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  47.47 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  47.66 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  45.83 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  46.51 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  48.13 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  50.73 
 
 		 224 aa  216  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  49.08 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  46.76 
 
 		 286 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  47.66 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  46.98 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  46.98 
 
 		 225 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  48.61 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  47.89 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  47.89 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  45.87 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  45.24 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  50.46 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  45.33 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  43.26 
 
 		 269 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  43.26 
 
 		 273 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  47.44 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  43.06 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  44.65 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  40.55 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  41.78 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  40.38 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  37.56 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  39.44 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  39.44 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  47.17 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  36.36 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  39.83 
 
 		 424 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.05 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  37.5 
 
 		 416 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 157 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.19 
 
 		 549 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  36.65 
 
 		 394 aa  143  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  42.19 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  39.8 
 
 		 400 aa  141  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  38.24 
 
 		 416 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  38.74 
 
 		 435 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.37 
 
 		 436 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 429 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.34 
 
 		 549 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  33.62 
 
 		 438 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.34 
 
 		 549 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  35.78 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 405 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  33.9 
 
 		 408 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.34 
 
 		 549 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  38.5 
 
 		 432 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 393 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 393 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.89 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 390 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  34.89 
 
 		 390 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  33.62 
 
 		 498 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  38.58 
 
 		 424 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  36.15 
 
 		 422 aa  137  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  34.48 
 
 		 472 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.5 
 
 		 421 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  37.82 
 
 		 429 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.5 
 
 		 421 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  38.1 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  38.79 
 
 		 412 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  38.61 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  36.36 
 
 		 449 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  37.44 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  40 
 
 		 411 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  36.41 
 
 		 443 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>