More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5954 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  58.49 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  58.02 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  52.58 
 
 		 229 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  50.46 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  53.05 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  51.38 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 273 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  49.53 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  49.53 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  50.7 
 
 		 216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  49.3 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  49.06 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  47.89 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  48.61 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  49.76 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  48.84 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  49.3 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  48.85 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  48.58 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  48.85 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  49.53 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  46.48 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  48.11 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  48.11 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  50.48 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  44.44 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  52.09 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  44.44 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  45.79 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  47.66 
 
 		 222 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  48.29 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  47.89 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  46.05 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  42.33 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  41.78 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  41.86 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  44.6 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  44.86 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  44.8 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  43.93 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  41.59 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  53.29 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  42.99 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  38.25 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 393 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 393 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 157 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  41.08 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36.87 
 
 		 264 aa  141  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  40.22 
 
 		 424 aa  141  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  42.08 
 
 		 253 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  40.22 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.44 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  37.36 
 
 		 394 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  38.24 
 
 		 402 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  35.19 
 
 		 392 aa  137  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.03 
 
 		 405 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 415 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  40 
 
 		 435 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  39.7 
 
 		 429 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.57 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.8 
 
 		 429 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  36.73 
 
 		 711 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  38.92 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  37.25 
 
 		 416 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  41.85 
 
 		 296 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  42.62 
 
 		 436 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  39.89 
 
 		 424 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  36.71 
 
 		 270 aa  134  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  37.7 
 
 		 432 aa  134  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  34.83 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  36.79 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  35.68 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  37.13 
 
 		 406 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  34.18 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  34.18 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  39.34 
 
 		 443 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  36.04 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  36.27 
 
 		 421 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  37.16 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  37.37 
 
 		 410 aa  131  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  36.27 
 
 		 421 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  35.29 
 
 		 405 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>