More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3811 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  60.75 
 
 		 217 aa  276  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  59.81 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  55.14 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  55.14 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  55.24 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  53.74 
 
 		 217 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  53.27 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  54.72 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  51.61 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  51.89 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  50.69 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  50.7 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  47.03 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  48.15 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  48.15 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  46.76 
 
 		 225 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  50.68 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  48.13 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  46.3 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  46.67 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  47.25 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  46.67 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  45.37 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  46.51 
 
 		 217 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  47.22 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  44.5 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  44.5 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 273 aa  204  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  44.91 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  45.28 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  46.01 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  43.98 
 
 		 286 aa  201  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  48.04 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  42.99 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  45.97 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  42.45 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  40.67 
 
 		 217 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  42.99 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  40 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  43.6 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  44.34 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  47.2 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  39.17 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  38.97 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 157 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  35.58 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  37.2 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  38.43 
 
 		 390 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 390 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  40.29 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  39.3 
 
 		 438 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  37.85 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  36.94 
 
 		 424 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  42.71 
 
 		 412 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  38.19 
 
 		 436 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 405 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  37.5 
 
 		 432 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  39.32 
 
 		 416 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  39.69 
 
 		 429 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.83 
 
 		 417 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  36.32 
 
 		 498 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.02 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  37.62 
 
 		 437 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  37.24 
 
 		 435 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  41.08 
 
 		 428 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 415 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  40.32 
 
 		 427 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  39.67 
 
 		 424 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 422 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  40 
 
 		 427 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.04 
 
 		 421 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 		 429 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  34.76 
 
 		 472 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  41.3 
 
 		 423 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  39.25 
 
 		 406 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.04 
 
 		 421 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 		 250 aa  134  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  40 
 
 		 405 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  36.28 
 
 		 410 aa  134  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 416 aa  134  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  37.56 
 
 		 422 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  38.38 
 
 		 418 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  34.63 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  39.68 
 
 		 429 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  38.59 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.28 
 
 		 400 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>