More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1152 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  80.65 
 
 		 217 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  73.11 
 
 		 218 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  73.11 
 
 		 218 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  68.54 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  65.28 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  67.28 
 
 		 222 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  66.36 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  66.36 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  66.36 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  66.36 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  59.91 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  63.72 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  63.72 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  60.75 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  60.47 
 
 		 217 aa  270  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  52.53 
 
 		 224 aa  257  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  56.81 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  51.89 
 
 		 217 aa  237  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  69.54 
 
 		 157 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  50.93 
 
 		 221 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  47.66 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  48.08 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  47.66 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  45.19 
 
 		 220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  46.73 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  46.95 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  45.79 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  46.3 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  42.59 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  43.38 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  44.91 
 
 		 286 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  44.5 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  45.91 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  44.71 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  43.72 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  42.72 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  45.41 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  43.19 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  44.6 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  39.81 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  41.59 
 
 		 216 aa  187  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  40.83 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  43.84 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  41.12 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  41.12 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  42.25 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  38.03 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  39.72 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  39.44 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  38.03 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  38.81 
 
 		 410 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  37.79 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.39 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 390 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.07 
 
 		 264 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  35.93 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  36.08 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  39.09 
 
 		 424 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  42.76 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  39.09 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 440 aa  138  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.53 
 
 		 549 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.07 
 
 		 455 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  37.06 
 
 		 429 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  38.12 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  38.12 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  37.16 
 
 		 432 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  35.1 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  37.91 
 
 		 464 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  35.29 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  35.29 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  39.34 
 
 		 400 aa  132  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  35.15 
 
 		 392 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 		 429 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  36 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  40.72 
 
 		 248 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  34.89 
 
 		 472 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  36.76 
 
 		 430 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  32.84 
 
 		 402 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  37.08 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  32.2 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  34.69 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  36.04 
 
 		 418 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  36.61 
 
 		 456 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.13 
 
 		 436 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  34.8 
 
 		 416 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  34.83 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>