More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4940 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  100 
 
 		 230 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  46.08 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  41.74 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  38.71 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  38.81 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  44.8 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  38.39 
 
 		 219 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  37.04 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  40.47 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  37.79 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  40.57 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  37.73 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  33.49 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  37.56 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  34.42 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  36.36 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  36.36 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  35.38 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  37.79 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  35.91 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  37.61 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  34.39 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  36.7 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  34.6 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  37.85 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  34.56 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  35.48 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  36.41 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  33.94 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  35.32 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  37.5 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  37.5 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  36.36 
 
 		 216 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  32.87 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  33.64 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  32.57 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  32.11 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  32.11 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  34.7 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  31.19 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  33.64 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  33.33 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  31.58 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  29.79 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  32.66 
 
 		 254 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  33.66 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 		 157 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  30.36 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  29.46 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  31.94 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  33.88 
 
 		 456 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  32.06 
 
 		 435 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  33.48 
 
 		 478 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  32.16 
 
 		 260 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  31.32 
 
 		 455 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  33.15 
 
 		 435 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  32.66 
 
 		 416 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  30.88 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  31.05 
 
 		 436 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 429 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 264 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  30.25 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  32.19 
 
 		 433 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  32.34 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  29.09 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  29.91 
 
 		 472 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  31.69 
 
 		 649 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  32.61 
 
 		 421 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  32.65 
 
 		 816 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  34.95 
 
 		 412 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  31.31 
 
 		 406 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  30.67 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  30.67 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  35.52 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  28.89 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  30.65 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  29.38 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  34.94 
 
 		 179 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.23 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  32.07 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  32.34 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  29.15 
 
 		 429 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  28.76 
 
 		 549 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  31.66 
 
 		 430 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  29.86 
 
 		 427 aa  99.4  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>