More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0524 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  99.36 
 
 		 218 aa  330  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  99.36 
 
 		 218 aa  330  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  99.36 
 
 		 218 aa  330  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  99.36 
 
 		 218 aa  330  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 157 aa  329  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  69.54 
 
 		 217 aa  227  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  66.89 
 
 		 217 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  64.94 
 
 		 217 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  67.76 
 
 		 222 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  62.09 
 
 		 216 aa  215  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  67.79 
 
 		 218 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  67.79 
 
 		 218 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  57.89 
 
 		 232 aa  192  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  58.55 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  59.6 
 
 		 217 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 217 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  58.44 
 
 		 217 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 224 aa  186  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  57.89 
 
 		 215 aa  185  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  53.1 
 
 		 220 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  46.41 
 
 		 220 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  49.66 
 
 		 216 aa  163  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  46.1 
 
 		 217 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  45.75 
 
 		 218 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  49.67 
 
 		 221 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 218 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  43.87 
 
 		 217 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  46.15 
 
 		 217 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  46.15 
 
 		 217 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  42.38 
 
 		 273 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  42.38 
 
 		 269 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  46.48 
 
 		 219 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  46.1 
 
 		 233 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  41.89 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 217 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  40.79 
 
 		 225 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  40.79 
 
 		 225 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  39.6 
 
 		 217 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  42.67 
 
 		 229 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 220 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 220 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  40.79 
 
 		 219 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  40.79 
 
 		 225 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 220 aa  130  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 223 aa  130  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  42.95 
 
 		 286 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  45 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  38.03 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  39.74 
 
 		 217 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  41.06 
 
 		 216 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  40.94 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  38.41 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  39.47 
 
 		 218 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  41.61 
 
 		 224 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  39.61 
 
 		 221 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  41.1 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 264 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 264 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  35.26 
 
 		 230 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 264 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  34.21 
 
 		 219 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.91 
 
 		 400 aa  104  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  38 
 
 		 266 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  33.55 
 
 		 410 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  38.36 
 
 		 238 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  39.69 
 
 		 464 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  38.24 
 
 		 392 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  35.86 
 
 		 424 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  34.38 
 
 		 498 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  32.19 
 
 		 549 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  34.84 
 
 		 416 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  36.76 
 
 		 456 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 390 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.82 
 
 		 390 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  35.17 
 
 		 252 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  34 
 
 		 219 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  32.47 
 
 		 443 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 		 440 aa  95.5  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  34.25 
 
 		 219 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  32.43 
 
 		 432 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.77 
 
 		 264 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  33.33 
 
 		 455 aa  94.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.64 
 
 		 429 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  37.5 
 
 		 423 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  37.21 
 
 		 249 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 393 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 393 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  38.19 
 
 		 394 aa  93.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  40.69 
 
 		 430 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  33.12 
 
 		 711 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  35.1 
 
 		 424 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  38.52 
 
 		 250 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  38.52 
 
 		 250 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  35.86 
 
 		 408 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  32.43 
 
 		 436 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  34.23 
 
 		 418 aa  91.3  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  31.97 
 
 		 549 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  31.97 
 
 		 549 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  31.97 
 
 		 549 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  34.44 
 
 		 241 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>