More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3014 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2633  ABC transporter related  39.91 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  43.28 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  39.81 
 
 		 816 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  40.45 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  41.75 
 
 		 498 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  41.63 
 
 		 438 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  39.35 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  38.66 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  42.72 
 
 		 549 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  40.1 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  39.3 
 
 		 605 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 469 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  42.08 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 469 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.58 
 
 		 435 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 471 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43 
 
 		 443 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  40.33 
 
 		 394 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  38.64 
 
 		 418 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  41.58 
 
 		 450 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  38.72 
 
 		 649 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  40.77 
 
 		 412 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 415 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 		 429 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  41 
 
 		 448 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  43.72 
 
 		 390 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  43 
 
 		 424 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  40.1 
 
 		 409 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 390 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 		 416 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  41.5 
 
 		 455 aa  165  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  39.8 
 
 		 436 aa  165  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  40.49 
 
 		 425 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  43.24 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  41.67 
 
 		 464 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.97 
 
 		 456 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  43.48 
 
 		 430 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  38.5 
 
 		 422 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  40.49 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 439 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  40.18 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  40.87 
 
 		 472 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  42.71 
 
 		 427 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  41.79 
 
 		 549 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  41.79 
 
 		 549 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  41.79 
 
 		 549 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 410 aa  161  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  38.14 
 
 		 405 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.56 
 
 		 429 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  39.29 
 
 		 422 aa  161  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  39.51 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  41.58 
 
 		 446 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  41.09 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  37.3 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  39.51 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  42.21 
 
 		 447 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  43.22 
 
 		 468 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  35.34 
 
 		 424 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  40.98 
 
 		 439 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  40 
 
 		 416 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  36.69 
 
 		 711 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  39.6 
 
 		 423 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  41.58 
 
 		 435 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  35.98 
 
 		 416 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  35 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.33 
 
 		 424 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  40.29 
 
 		 870 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.34 
 
 		 415 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  40.2 
 
 		 428 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.41 
 
 		 400 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  37.14 
 
 		 406 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 405 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  42.39 
 
 		 400 aa  156  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  35.39 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  38.76 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.85 
 
 		 421 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  40 
 
 		 369 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  39.2 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  39.6 
 
 		 411 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 440 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  38.92 
 
 		 435 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.85 
 
 		 421 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.05 
 
 		 397 aa  155  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  38.5 
 
 		 427 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  37.81 
 
 		 431 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  39.3 
 
 		 449 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  38.71 
 
 		 488 aa  154  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>